Bảng A
XH Đội bóng Tr T H B +/- Điểm
1 PAOK Saloniki 6 3 3 0 4 12
2 Rubin Kazan 6 3 2 1 6 11
3 Tottenham Hotspur 6 3 1 2 5 10
4 Shamrock Rovers 6 0 0 6 -15 0
Bảng B
XH Đội bóng Tr T H B +/- Điểm
1 Standard Liege 6 4 2 0 8 14
2 Hannover 96 6 3 2 1 2 11
3 FC Copenhagen 6 1 2 3 -4 5
4 FC Vorskla Poltava 6 0 2 4 -6 2
Bảng C
XH Đội bóng Tr T H B +/- Điểm
1 PSV Eindhoven 6 5 1 0 8 16
2 Legia Warszawa 6 3 0 3 -2 9
3 Hapoel Tel Aviv 6 2 1 3 1 7
4 FC Rapid Bucuresti 6 1 0 5 -7 3
Bảng D
XH Đội bóng Tr T H B +/- Điểm
1 Sporting Lisbon 6 4 0 2 4 12
2 Lazio 6 2 3 1 2 9
3 FC Vaslui 6 1 3 2 -3 6
4 Zurich 6 1 2 3 -3 5
Bảng E
XH Đội bóng Tr T H B +/- Điểm
1 Besiktas JK 6 4 0 2 6 12
2 Stoke City 6 3 2 1 3 11
3 Dynamo Kyiv 6 1 4 1 0 7
4 Maccabi Tel Aviv 6 0 2 4 -9 2
Bảng F
XH Đội bóng Tr T H B +/- Điểm
1 Athletic Bilbao 6 4 1 1 3 13
2 Red Bull Salzburg 6 3 1 2 3 10
3 Paris Saint Germain 6 3 1 2 1 10
4 Slovan Bratislava 6 0 1 5 -7 1
Bảng G
XH Đội bóng Tr T H B +/- Điểm
1 Metalist Kharkiv 6 4 2 0 9 14
2 AZ Alkmaar 6 1 5 0 3 8
3 Austria Wien 6 2 2 2 -1 8
4 Malmo FF 6 0 1 5 -11 1
Bảng H
XH Đội bóng Tr T H B +/- Điểm
1 Club Brugge 6 3 2 1 3 11
2 Sporting Braga 6 3 2 1 6 11
3 Birmingham 6 3 1 2 0 10
4 NK Maribor 6 0 1 5 -9 1
Bảng I
XH Đội bóng Tr T H B +/- Điểm
1 Atletico Madrid 6 4 1 1 7 13
2 Udinese 6 2 3 1 -1 9
3 Celtic 6 1 3 2 -1 6
4 Stade Rennais FC 6 0 3 3 -5 3
Bảng J
XH Đội bóng Tr T H B +/- Điểm
1 Schalke 04 6 4 2 0 11 14
2 Steaua Bucuresti 6 2 2 2 -2 8
3 Maccabi Haifa 6 2 0 4 -2 6
4 AEK Larnaca 6 1 2 3 -7 5
Bảng K
XH Đội bóng Tr T H B +/- Điểm
1 FC Twente Enschede 6 4 1 1 7 13
2 Wisla Krakow 6 3 0 3 -5 9
3 Fulham 6 2 2 2 3 8
4 Odense BK 6 1 1 4 -5 4
Bảng L
XH Đội bóng Tr T H B +/- Điểm
1 Anderlecht 6 6 0 0 13 18
2 Lokomotiv Moscow 6 4 0 2 3 12
3 AEK Athens 6 1 0 5 -7 3
4 Sturm Graz 6 1 0 5 -9 3
Chú ý: Đội bóng có dấu màu đỏ đã được lọt vào vòng tiếp theo.